Öz

Amaç

Yaşlanan toplumlarda, en nihayetinde kalp yetmezliğine ilerleyen progresif mitral kapak hastalıkları nedeniyle hastaneye yatışlar ve mitral kapak ameliyatları daha yaygın hale gelmiştir. Gelişmekte olan ülkelerde, dejeneratif mitral kapak yetersizliği (DMVR) cerrahi tedavi gerektiren mitral yetersizliğinin önde gelen nedenidir. Bununla birlikte, altta yatan patolojik süreçlerin moleküler biyoloji yaklaşımıyla daha derinlemesine anlaşılması klinik yönetimi iyileştirebilir. Bu araştırmada, DMVR’li hastalardan alınan atriyum dokularının transkriptom verisi kullanılarak, altta yatan patofizyolojik moleküler mekanizmaları aydınlatmak amacıyla biyoinformatik analizler yapılmıştır.

Gereç ve Yöntem

Biyoinformatik analizler, Gen Ekspresyon Omnibus (GEO) veritabanından GSE115574 veriseti kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Sinüs ritmindeki DMVR hastalarında (n=16) insan sol atriyum ve sağ atriyum elde edilen ve GEO veritabanından CEL dosyaları olarak indirilen transkriptom verisi biyoinformatik analizleri yapmak için kullanılmıştır. Gen ekspresyon mikroarray analizleri daha öncesinde Affymetrix platformunda gerçekleştirilmiştir. Biyoinformatik, gen ontolojisi ve fonksiyonel zenginleştirme analizleri Partek GS V7.0 ve WebGestalt yazılımlarında gerçekleştirilmiştir.

Bulgular

Bu çalışmanın bulguları, DMVR patofizyolojisinde birden fazla genin ve çeşitli yolakların rol oynadığını ortaya koymaktadır. Tüm dönüştürücü büyüme faktörü-beta (TGF-β) ve Wnt sinyal yolakları arasında yanlış keşif oranı eşiklerine ve zenginleştirilmiş gen seti değerlerine göre aydınlatılmıştır. TGF-β ve Wnt sinyal yolaklarında yer alan öne çıkan genler WNT5A, PLCB1, SFRP1, SMAD6, PITX2, SMAD7, ID2, BMP5 olarak tespit edilmiştir.

Sonuç

Erken teşhisi kolaylaştırmak ve hedefe yönelik müdahaleler geliştirmek için DMVR’nin moleküler mekanizmalarının tam olarak aydınlatılması önemlidir. TGF-β ve Wnt sinyal yolaklarının doğru şekilde yönetilmesi, DMVR progresyonunu yavaşlatmak ve daha karmaşık hale gelmesini önlemek için çözümler sunabilir.